一、检测背景与意义
- 工艺优化:监控菌体生长曲线,调整发酵条件(温度、pH、溶氧等)。
- 质量控制:确保终产品符合纯度、浓度及杂质残留标准。
- 成本控制:避免核酸降解或过度发酵,降低资源浪费。
二、核心检测项目及方法
1. 总核酸含量测定
-
- 原理:核酸在260 nm处有特征吸收峰,通过吸光度(A260)计算浓度(1 OD≈50 μg/mL双链DNA或40 μg/mL RNA)。
- 步骤:离心去除菌体→上清液稀释→测定A260值→扣除背景干扰(如蛋白质A280)。
- 优点:快速、成本低。
- 局限性:易受蛋白质、色素等杂质干扰。
-
- 原理:荧光染料(如SYBR Green、PicoGreen)与核酸结合后发射荧光,强度与核酸浓度正相关。
- 步骤:样品裂解→染料孵育→荧光检测(激发/发射波长匹配)。
- 优点:灵敏度高(可达pg级),抗干扰能力强。
2. RNA与DNA区分检测
- 酶解法:
- 步骤:使用RNase或DNase特异性降解RNA/DNA,剩余核酸通过UV法或荧光法测定。
- 举例:RNase处理后,剩余DNA浓度=总核酸 - RNA浓度。
- HPLC法:
- 原理:基于核酸分子量差异进行色谱分离,通过保留时间区分RNA与DNA。
- 优点:高分辨率,可同时检测多种核酸组分。
3. 微生物生物量关联检测
- 细胞干重(DCW):离心收集菌体→干燥称重。
- OD600值:通过浊度法快速估算活菌浓度。
4. 代谢副产物检测
- 高效液相色谱(HPLC):精确分析有机酸种类及浓度。
- 生化试剂盒:如乙酸、乳酸检测试剂盒(比色法)。
5. 核酸纯度检测
- A260/A280比值:纯DNA≈1.8,纯RNA≈2.0;若<1.6提示蛋白质污染。
- 琼脂糖凝胶电泳:观察核酸条带完整性,检测降解或片段化。
三、检测流程关键注意事项
- 样品预处理:
- 及时灭活发酵液中的核酸酶(如加入EDTA)。
- 离心除去菌体及颗粒物(建议10,000×g,10 min)。
- 标准曲线校准:每次检测需使用已知浓度的标准品(如λ-DNA)建立标准曲线。
- 数据校正:对高浓度样品需稀释至线性检测范围内,避免吸光度值超出仪器线性区间。
四、应用场景
- 医药行业:疫苗生产中微生物DNA残留检测(如《中国药典》要求)。
- 食品工业:酵母抽提物中RNA含量测定(调味品增鲜剂)。
- 合成生物学:工程菌株核酸合成效率评估。
五、总结
- 《微生物发酵过程中代谢产物分析技术》(专著)
- ISO 21571:2005 食品中核酸提取与定量标准
- 荧光定量PCR在核酸实时监测中的应用(研究论文)
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