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Lectin内源基因检测

发布时间:2025-06-08 20:37:48- 点击数: - 关键词:

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凝集素(Lectin)内源基因检测:关键环节与技术要素

凝集素(Lectins)是一类广泛存在于植物、动物和微生物中的蛋白质或糖蛋白,因其能够特异性识别并结合细胞表面的糖基配体而得名。在植物中,凝集素扮演着重要的生理角色,如参与防御反应、储存氮源以及细胞间识别等过程。然而,某些植物凝集素(如豆科植物中的血球凝集素)因其潜在的生物活性(如凝集红细胞、抑制营养吸收、甚至毒性)而受到关注,特别是在食品安全评估、转基因作物检测以及植物育种应用中。因此,凝集素内源基因检测成为一项关键的分子检测项目,旨在精准识别和定量特定植物物种或其加工产品中固有的凝集素基因或其表达水平,这对于评估食品原料的固有风险、转基因作物中内源基因的保留或表达改变、以及物种溯源等具有重要意义。

检测项目

凝集素内源基因检测的核心项目通常包括:

  • 定性检测: 确认目标样本中是否存在特定的内源凝集素基因(如大豆Lectin Le1基因、马铃薯凝集素基因、小麦凝集素基因等)。这是物种鉴定和转基因筛选的基础。
  • 定量检测: 精确测定目标凝集素基因在样本中的拷贝数(对于基因组DNA检测)或转录本水平(mRNA,对于基因表达分析)。这对于评估凝集素潜在含量或研究其表达调控至关重要。
  • 特异性检测: 确保检测方法能准确区分目标物种的凝集素基因与近缘物种或其他非目标凝集素基因,避免交叉反应。
  • 外源基因/内源基因共检测: 在转基因检测中,常将内源凝集素基因作为阳性对照或参考基因(如大豆检测中的Le1基因),以验证DNA抽提成功和PCR有效性,同时检测目标外源转基因元件。

检测仪器

进行凝集素内源基因检测主要依赖以下精密仪器:

  • 实时荧光定量PCR仪: 这是目前最主流的检测设备(如ABI 7500, Bio-Rad CFX96, Roche LightCycler 480)。用于进行实时荧光定量PCR (qPCR) 或数字PCR (dPCR),实现基因的定性、定量及高灵敏度检测。
  • 普通PCR仪: 用于基因片段的常规扩增,适用于定性检测或为后续测序等步骤准备样本。
  • 核酸提取工作站/仪器: 用于高效、自动化地从复杂样本(如种子、叶片、加工食品)中提取高质量基因组DNA或总RNA。
  • 电泳系统: 包括凝胶电泳槽和成像系统(如凝胶成像仪),用于PCR扩增产物的分离和定性分析。
  • 毛细管电泳仪: 用于更精确的片段大小分析和定量(尤其在dPCR后或微卫星分析中可能用到)。
  • 测序仪: 用于对PCR产物进行测序,以确认扩增片段的特异性或进行更深入的序列分析。

检测方法

凝集素内源基因检测主要基于分子生物学技术:

  • 聚合酶链式反应:
    • 普通PCR: 使用特异性引物扩增目标凝集素基因片段,通过凝胶电泳观察条带进行定性判断。
    • 实时荧光定量PCR: 使用特异性引物和探针(如TaqMan探针或SYBR Green染料),在扩增过程中实时监测荧光信号,通过标准曲线或Ct值进行绝对或相对定量。具有高特异性、高灵敏度和高通量优势,是目前主流的定量方法。
    • 数字PCR: 将PCR反应体系分割成大量微小单元进行独立扩增,直接计数阳性微滴数进行绝对定量,不依赖标准曲线,具有极高的精确度和对PCR抑制物的耐受性。
  • 环介导等温扩增: 在恒定温度下进行核酸扩增,无需热循环仪,设备要求简单,适用于现场快速筛查。
  • 基于CRISPR的检测: 新兴技术,利用CRISPR-Cas系统的特异性识别能力(如Cas12a, Cas13)结合等温扩增或报告信号系统,实现快速、高灵敏和高特异性的检测。
  • 测序: 对扩增产物进行Sanger测序或利用新一代测序技术,提供最准确的序列信息,用于确认和深入分析。

检测标准

凝集素内源基因检测的标准化对于确保结果的可比性、可靠性和法律效力至关重要。相关的国际和国家标准主要包括:

  • 国际标准:
    • ISO 21571: 规定了食品中转基因生物及其产品分析的核酸提取方法。
    • ISO 24276: 规定了转基因生物及其产品检测的总体要求和定义。
    • ISO 21569: 特别规定了基于核酸分析的转基因生物及其产品检测的定性方法(常包含内源基因检测作为质控)。
    • ISO 21570: 规定了基于核酸分析的转基因生物及其产品检测的定量方法(qPCR是其核心)。
    • 国际标准化组织(ISO)和国际食品法典委员会(CAC)的相关指南为方法建立和验证提供了框架。
  • 国家标准:
    • 中国:GB 19495系列标准(转基因产品检测)是核心标准。例如:
      • GB 19495.3 提供了核酸提取纯化的通用方法和要求。
      • GB 19495.4 规定了转基因产品实时荧光PCR检测方法,其中明确要求使用物种特异性内源基因(如大豆的Lectin基因)作为阳性对照和内标。
    • 欧盟:欧盟委员会指令(如2003/13/EC及其后续修订)规定了转基因检测的官方方法要求,通常参考欧洲标准化委员会(CEN)制定的标准。
    • 美国:美国农业部动植物卫生检验署(APHIS)、食品药品监督管理局(FDA)和环境署(EPA)有相关指南,美国官方分析化学家协会(AOAC)也制定有相关检测方法标准。
  • 核心要求: 无论采用何种具体标准,方法验证(特异性、灵敏度、准确度、精密度、稳健性、扩增效率等)和实验室质量控制(阴性/阳性对照、内标使用、防污染措施)是所有标准共同强调的重点。

综上所述,凝集素内源基因检测是食品安全监管、转基因产品标识、物种鉴定和基础研究中的一项关键分子检测技术。通过采用恰当的检测项目、精密的仪器设备、标准化的分子生物学方法(尤其是qPCR)并严格遵守国内外相关检测标准(如ISO系列和中国GB 19495系列),可确保检测结果的科学、准确、可靠和可溯源,为评估相关产品的安全性和合规性提供重要的科学依据。例如,在大豆及其深加工产品(如大豆油、大豆蛋白粉)的转基因检测中,大豆凝集素(Le1)基因的内源检测是法定的强制性检测环节,用于确认样本中是否含有大豆源性成分及其DNA的可扩增性。随着技术的进步,dPCR和基于CRISPR的检测方法有望在未来的标准中得到更广泛的应用,进一步提升检测能力。

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