1. 转基因生物（GMO）检测
- 基因序列特异性验证：通过PCR或测序确认CpTI基因在转基因作物中的整合位置及拷贝数。
- 表达水平定量：使用qRT-PCR或Western Blot检测CpTI蛋白的表达量，评估抗虫效果。
- 环境安全评估：检测基因漂移风险及对非靶标生物的影响。
2. 医学研究中的CpTI相关检测
- 基因工程载体构建验证：在基因治疗或药物递送系统中，检测CpTI作为功能模块的完整性和表达效率。
- 病理机制研究：探索CpTI类似蛋白酶抑制剂在癌症、炎症性疾病中的作用，例如通过敲除/过表达实验分析其对肿瘤侵袭的影响。
- 生物标志物筛选：检测血液或组织中CpTI同源物的表达水平，评估其与疾病预后的关联性。
3. 表观遗传学检测（如CpTI启动子甲基化）
- 甲基化水平分析：利用亚硫酸盐测序（BSP）或Methylation-Specific PCR（MSP）检测CpTI基因启动子区域的甲基化状态，研究其对基因沉默的影响。
- 与表型关联性：例如在转基因植物中，甲基化可能导致抗虫性下降，需定期监控。
4. 分子互作与功能验证
- 蛋白互作网络：通过Co-IP或酵母双杂交技术，鉴定CpTI蛋白与宿主（如人类细胞）中靶蛋白的结合能力。
- 酶活性抑制实验：评估CpTI对特定蛋白酶（如组织蛋白酶）的抑制效率，指导药物设计。
- PCR/实时荧光定量PCR：用于基因拷贝数、表达量分析。
- 下一代测序（NGS）：全基因组范围内检测CpTI的整合位点及突变。
- 质谱分析：精确测定CpTI蛋白的表达丰度及修饰状态。
- 免疫组化（IHC）：定位CpTI在组织中的分布。
- 农业领域：植物叶片、种子DNA/RNA。
- 医学领域：细胞系、血清、组织活检样本。
- 流程：样本采集→核酸/蛋白提取→靶标检测→数据分析→报告生成（含阈值判断及建议）。
- 农业：确保转基因作物符合法规要求，降低生态风险。
- 医学：为基因治疗载体设计提供质量控制，或发掘新型疾病治疗靶点。
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