非洲猪瘟二代测序检测

实验室拥有众多大型仪器及各类分析检测设备，研究所长期与各大企业、高校和科研院所保持合作伙伴关系，始终以科学研究为首任，以客户为中心，不断提高自身综合检测能力和水平，致力于成为全国科学材料研发领域服务平台。

非洲猪瘟病毒基因组大而复杂，毒株型别与毒力差异直接关系防控策略。二代测序技术可对病毒全基因组进行高通量测定，为疫情溯源、毒株分型与疫苗研究提供分子层面的数据支持。本页按样品制备、检测方法、性能指标到应用场景的顺序，说明该项检测的落地要点。

检测信息（部分）

本项检测针对非洲猪瘟病毒的核酸开展二代测序分析，从全基因组层面获取序列信息。送检前先明确样本类型与检测目的，有助于实验室选择合适的建库策略。
- 检测对象：感染猪只组织、血液及环境样本中的非洲猪瘟病毒核酸，属于病原体基因组层面的分子检测。
- 典型送检场景：疫情发生后需明确毒株基因型、可疑样本复核确认、引物探针失效时的序列核查等。
- 适用行业：生猪养殖与屠宰企业、兽医诊断机构、动物疫病科研院所、海关口岸检疫部门等。
- 报告可用于：疫情处置决策参考、内部生物安全质控、科研数据积累与种毒背景梳理。

检测项目（部分）

围绕基因组序列信息，本项检测可拆解为多个具体可测内容，委托方可按需求单项或组合送检。
- 病毒全基因组测序：测定非洲猪瘟病毒基因组的完整序列，覆盖多基因家族区段等复杂区域。
- 部分基因区段测序：针对特定可变区做靶向测序，用于快速分型与初步溯源。
- 基因型别鉴定：依据序列比对结果判定毒株所属基因型，反映其地理来源与演化关系。
- 单核苷酸多态性分析：识别序列中的位点变异，用于区分近似毒株与追踪传播链。
- 插入缺失突变检测：分析基因组中片段的插入或缺失，表征毒株的基因组结构特征。
- 多基因家族拷贝数分析：评估 MGF 等重复基因家族的成员拷贝变化，关联毒力表型研究。
- 混合感染判定：通过测序 reads 的序列差异，判断样本中是否存在多个毒株共感染。
- 病毒载量相对评估：以测序覆盖深度间接反映样本中病毒核酸的相对丰度。
- 宏转录组病原筛查：对临床样本中全部核酸进行无偏测序，同时排查其他共存病原。
- 变异位点注释：将检测到的变异与已知功能区域对应，辅助判断毒力相关变化。

检测范围（部分）

凡可能携带非洲猪瘟病毒或涉疫监测的材料，均可作为测序检测的受理对象，具体以下几类。
猪抗凝全血、猪血清、脾脏、淋巴结、扁桃体、肺脏、肾脏、骨髓、精液、粪便、口鼻拭子、组织匀浆上清。
猪肉及猪肉制品、香肠火腿等加工品、冻品分割肉、饲料原料、餐厨废弃物、运输车辆与环境拭子、养殖场污水、垫料与粪污样本。
其中组织类样本含毒量高，最适合作全基因组测序；环境与加工品类样本病毒多已降解，宜配合富集策略送检。

检测仪器（部分）

测序链条较长，实验室需配置从核酸提取到序列分析的成套设备，各环节仪器分工如下。
- 高通量测序仪：完成文库片段的并行测序，产出原始序列数据，是本项检测的核心设备。
- 实时荧光定量PCR仪：用于测序前的核酸粗筛与载量评估，指导建库上样量。
- 核酸蛋白测定仪：测定提取核酸的浓度与纯度，判断样本是否满足建库要求。
- 凝胶电泳系统：检测文库片段大小分布，确认建库质量合格后再上机。
- 生物安全柜：为涉疫样本的处理与核酸提取提供负压防护操作环境。
- 台式高速冷冻离心机：完成样本预处理、核酸提取与文库纯化中的各步离心操作。
- 微量分光光度计：对微量核酸样本做快速定量，辅助稀释与均一化。
- 恒温金属浴：控制酶反应与文库制备中的孵育温度，保证反应条件稳定。
- 高性能计算服务器：承担海量测序数据的比对、拼接与注释运算。

检测方法（部分）

从核酸提取到生信分析，本项检测依托以下成熟方法类别组合完成，不同情形选用不同路径。
- 磁珠法核酸提取：以磁性硅珠吸附核酸，适合含抑制物较多的组织与环境样本。
- 柱提法核酸提取：利用硅膜柱纯化核酸，操作简便，适合血液与拭子类样本。
- 实时荧光PCR法：以特异性引物探针扩增靶基因并监测荧光信号，用于测序前筛查确认。
- PCR扩增子测序法：针对目标区段设计引物扩增后建库测序，适合低载量样本的靶向分型。
- 宏基因组测序法：不经特异性扩增直接对样本全部核酸测序，适合未知病原与混合感染排查。
- 滚环扩增辅助测序法：对环形或末端闭合的病毒基因组先扩增再测序，提升末端区覆盖。
- 生物信息学序列比对法：将测序 reads 与参考基因组比对，获得一致序列与变异信息。
- 系统进化分析法：基于序列相似度构建进化树，用于毒株分型与传播关系推断。

检测优势

- 覆盖全基因组到靶向区段的多种测序方案，可按样本状态与检测目的灵活组合。
- 具备权威资质认证的实验室承接，涉疫样本在生物安全条件下规范处理。
- 团队积累了猪病分子检测的制样与建库经验，应对降解样本与低载量样本有成熟策略。
- 报告可用于内部质控与疫情处置参考，也可用于贸易交接环节的疫病状态证明材料。
- 数据分析不预设单一毒株，以原始 reads 与比对结果如实呈现，供委托方复核。

检测流程

1. 沟通需求：明确样本类型、检测目的与测序范围，由技术顾问初步判断方案可行性。
2. 方案与报价确认：确定建库策略、数据量与交付内容，双方确认后安排送检。
3. 寄样或现场采样：按采样规范寄送冷链样本，或预约人员赴现场采集。
4. 实验室检测：完成核酸提取、质控筛查、建库测序与数据产出全流程。
5. 数据审核出具报告：生信分析后经双人复核，出具含序列数据的检测报告。
6. 报告解读与售后：技术人员解读基因型与变异结果，并留存数据备查答疑。

样品制备与要求

样本质量直接决定测序成败，送检前请按以下要点准备。组织样本取病变明显部位，切成黄豆大小块状，每份不少于适量组织，避免反复冻融。血液样本以抗凝管采集，采后尽快冷藏送检，避免溶血与高温暴露。环境拭子与饲料类样本需标明采样位置与批次，单独密封防止交叉污染。全程冷链运输，附采样记录与检测目的说明；样本不全或保存不当的，实验室会在受理环节告知补样要求。 非洲猪瘟防控对分子层面信息的需求日益增加，二代测序能把毒株身份与变异情况讲清楚，为处置决策与科研工作给出可核查的序列证据。如有组织、血液或环境样本的测序需求，欢迎联系本站技术顾问沟通方案与报价。